הרופא המבצע ניתוח מעקף צריך לעבור הכשרה ממושכת ומעמיקה בתחום הכירורגיה. זה כולל למידה מתמקדת בכירורגיה כללית, כירורגיה בטנית וכירורגיה מינימלית התערבותית. הרופא צריך להיות מיומן בניתוחים מורכבים ומדויקים שדורשים תכנון מדויק, קפדנות ומיומנות טכנית גבוהה. נדרשת גם התמחות בהבנת האנטומיה של הבטן והמעי. בנוסף, הרופא צריך להיות מיומן בערכת חולים, בהכנה לניתוח ובטיפול פוסט-אופרטיבי.