תזונה חלשה של חלבונים-אנרגיה יכולה להוביל למספר השלכות בריאותיות לאחר ניתוח מעקף קיבה. התוצאות עשויות לכלול אובדן משקל חפוז, חולשה, אי-ספיקה חלבונית, אי-נעול הקיבה ואף מוות. על מנת למנוע את מצבים אלו, חייבים להבטיח שהאדם מקבל את החלבונים והאנרגיה הנדרשים במהלך תהליך ההחלמה.