אסטרטגיות המניעה בניתוח מעקף קיבה כוללות מספר שלבים. כל אחד מהם מתרחש בזמן שונה בתהליך הניתוח. יש להכין את המטופל באופן נאות, כולל ניהול תזונה נכונה וכשרונות לחימה במתח. בזמן הניתוח, נעשים בדיקות לשמירה על סטריליות הניתוח וניהול נכון של התרופות. לאחר הניתוח, חייבים לבצע מעקב אחרי המטופל ולנהל שיחות עם צוות הבריאות שלו, כדי לוודא שהוא מתאושש באופן תקני ולמנוע תופעות לוואי.