הטיפול בתסמונת אהלרס-דנלוס מתמקד בהפחתת התסמינים ובמניעת מצבים חמורים יותר. הטיפול יכול לכלול תרופות לשליטה בכאב, תרגילים לשיפור חוזק השרירים והמהירות, ולמעיתים ניתוחים. מומחים במגוון תחומים כולל רופאי שיקום, תזונאים, פיזיותרפיסטים ואחרים יכולים לסייע בניהול המחלה.