הטיפול במיגרנה כרונית כולל שילוב של תרופות מרשם ושינוי סגנון חיים. תרופות נפוצות הן מניעתיות (בוטוקס, תרופות לחץ דם, אנטידיפרסנטים) ותרופות שמשפרות את התסמינים (אנלגזיקים, אנטימיאטיקים). שינוי סגנון החיים עשוי לכלול מניעת מנגנונים מוכרים של המיגרנה, כולל שינוי בתזונה, הוספת פעילות גופנית, והפחתת חשיפה למתח ולחץ.